第三章:实时荧光定量PCR的应用
一、相对定量测定不同样品中基因表达量的相对值
内参基因的选择对结果的有效性至关重要,以下是选择内参基因应遵循的原则:
(1) 始终选择表达稳定且丰富的基因作为内参基因;
(2) 不要盲目选择常用的内参基因;
(3) 常用的内参基因包括GAPDH、Actin及Tubulin。
在选定内参基因后,将其加入计算中,以获取相对表达量的结果。
二、绝对定量
绝对定量是通过标准品测定样品中基因表达量的绝对值(拷贝数)。标准品可包括:
A. 具有已知拷贝数浓度的样品
B. 克隆质粒
C. PCR产物
D. cDNA(注意:扩增效率测定等用途可以使用,但绝对定量时不能使用)
拷贝数的计算方法如下:
平均分子量(MW)计算:
dsDNA = (碱基数) x (660道尔顿/碱基)
ssDNA = (碱基数) x (330道尔顿/碱基)
ssRNA = (碱基数) x (340道尔顿/碱基)
拷贝数计算公式为:
拷贝数 = (6.02 x 1023 拷贝数/摩尔) x (浓度 g/ml) / (MW g/mol) = copies/ml
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