尊龙凯时的最新研究揭示了胃癌进展的克隆动态，文章标题为《肠道化生的时空基因组分析揭示胃癌进展的克隆动态》，发表于2023年12期的《癌细胞》期刊，影响因子为5.03。该研究利用单细胞测序、GeoMx DSP、全外显子测序（WES）和大规模RNA测序等实验平台，定制了277个相关基因的胃癌Panel，这些基因来源于TCGA以及其他研究中报道的胃、食道和结直肠癌突变基因。

样本信息

研究中包含2980名年龄在50岁及以上的中国患者，样本采集时间跨度从2004年到2015年，涉及的取样区域包括多个胃部区域，如幽门、胃体和贲门。

单细胞空间组学的应用

在单细胞测序中，首先对10名非癌症受试者进行scRNA-seq分析，识别出包括胃细胞群、肠道细胞群、免疫细胞群及基质细胞群在内的四大主要细胞系。重点关注胃和肠的谱系，从而对亚群进行了注释，确认了两种胃细胞和四种肠细胞的存在。细胞比例分析显示，肠道细胞和胃细胞的比例减少与肠道化生（IM）的严重程度相关。同时，SOX9的基因表达在特定细胞类型（如胃LYZ+细胞和肠道干细胞）中显著升高。

GeoMx DSP分析

在GeoMx DSP技术中，从八名胃癌患者中选择组织切片进行检测，并结合scRNA-seq数据确定细胞类型的空间分布。研究结果将每个肠道化生区域标记为“干细胞显性”或“肠细胞显性”。富集分析表明，在干细胞显性IM区域，氧化磷酸化相关基因集的表达显著上调，且在胃癌区域也有明显的表达。经过分层聚类分析，发现干细胞显性IM与胃癌群体的基因表达特征相似，而肠细胞主导型IM则与胃癌表现出显著的异质性，显示同一受试者中肠道化生的不均匀性。

研究总结

本研究结合单细胞空间数据分析，确定了肠道细胞与胃细胞在肠道化生严重程度中的相关性，且发现干细胞显性IM在基因表达特征上与恶性细胞群相似。突出SOX9在特定细胞类型中的高表达，为相关研究和临床治疗提供了新视角。

通过尊龙凯时的研究，希望能够进一步推动胃癌早期诊断与治疗的发展，为患者带来更好的预后结果。