中文

English

尊龙凯时:SomaScan与Olink实测数据对比分析

发布时间:2025-03-19   信息来源:彭寒磊

在多种血液蛋白质组检测技术中,除了传统的基于质谱技术的非靶向方法外,基于亲和力平台的高通量靶向蛋白质组技术——SomaScan和Olink备受研究者喜爱。这两种技术均已为研究人员提供了大量数据和有价值的信息,形成了“蛋白检测双子星”的竞争局面。目前,SomaScan已升级至11K,而Olink则更新至5K。在选择这两种技术时,研究人员可能会感到困惑。为帮助大家更好地理解这两大技术,本文整理了近两年关于这两个平台比较的相关文章,涵盖检测稳定性与精确度、检测灵敏度、检测蛋白数量与范围等多个方面,供研究人员参考。

尊龙凯时:SomaScan与Olink实测数据对比分析

第一篇研究

2023年,一项研究分析了48684位UKBiobank参与者的Olink蛋白质组学数据与35892名冰岛人群的SomaScan蛋白质组学数据,探讨了这些样本的蛋白质水平与基因型和表型信息的关联。此外,有1514人同时接受了OlinkExplore3072和SomaScan5K的检测,研究者对两个平台的数据进行了详细的分析。研究结果表明,这两种高通量蛋白质组学平台提供的信息是有价值的,同时也揭示了它们之间的差异,并在某些情况下展现出有用的互补性。最终更新的结果显示,Olink的CV值显著高于SomaScan,而SomaScan的精确度更高。链接:[Nature](https://wwwnaturecom/articles/s41586-024-07549-z)

第二篇研究

2025年的研究比较了OlinkExplore3072和SomaScan11K在4000名中国成年人中检测2168种血浆蛋白质的性能。主要结论如下:(1)两种平台的蛋白水平相关性较低(中位数Spearman相关系数ρ=0.29),其中蛋白丰度和数据质量被认为是影响相关性的关键因素;(2)在1694种唯一匹配的蛋白中,Olink平台和SomaScan平台分别确认了765种和513种带有顺式蛋白数量性状位点(cis-pQTLs),400种蛋白的cis-pQTLs在两个平台间共定位;(3)Olink和SomaScan分别有1096种和1429种蛋白与体质指数(BMI)相关;(4)Olink和SomaScan分别有279种和154种蛋白与缺血性心脏病(IHD)风险相关;(5)将Olink和SomaScan的蛋白水平与传统IHD风险因素结合后,ROC的AUC从0.845分别提高到0.862和0.863。这些结果展示了这两种平台的实用性,为未来研究的设计和解释提供了依据。链接:[DOI](https://doiorg/101038/s41467-025-56935-2)

第三篇研究

2024年的一项研究对Atherosclerosis Risk in Communities (ARIC) Study中的102名患者进行了SomaScan11K和OlinkExploreHT(5400+蛋白)检测,并进行了比较。主要结论包括:(1)Olink中超过50%的蛋白无法在一半样本中检出,而SomaScan的所有检测均高于检测下限,显示出更高的灵敏度;(2)SomaScan的CV中值为6.8%,显著低于OlinkHT的35.7%。在产品迭代过程中,SomaScan保持了良好的稳定性,而Olink的新增加蛋白则带来了更高的不稳定性;(3)在重复样本检测中,SomaScan的相关性更好,中位值为0.85,Olink为0.65;(4)SomaScan的cis-pQTL数量约为2800,而Olink约为2100;(5)通过对两平台共同检测的超4400种蛋白分析,总体相关性较低,其中三分之一的蛋白表现出良好的跨平台相关性。链接:[DOI](https://doiorg/101101/2024071124310161)

第四篇研究

2025年,研究者利用七种蛋白质组学平台(包括SomaScan11K、SomaScan7K和Olink5K等)对78个个体的血浆进行了检测和比较。主要结论包括:(1)共鉴定了13007个独特蛋白,其中SomaScan11K和7K的检测覆盖最多;(2)SomaScan平台的CV值最低,表现为最准确和稳定的技术;(3)从缺失值的角度评价数据完整性,SomaScan平台表现最好;(4)SomaScan平台97%的蛋白在线性范围,而Olink5K的比例仅为42%;(5)SomaScan覆盖的FDA批准的人血浆蛋白质生物标志物占比最高。链接:[DOI](https://doiorg/101101/20250214638375)

综上所述,针对大样本的SomaScan平台与Olink平台的比较显示,SomaScan在整体检测蛋白数量及稳定性等方面表现更为优越。因此,在血液大队列研究中,SomaScan平台是一个理想的选择!尊龙凯时推荐【中科新生命】SomaScanP7K/P11K,开启血液万级蛋白质组检测新纪元!这一平台突破了血液蛋白质组检测的限制,深、稳、准三位一体的检测为血液蛋白标志物的发现和临床转化创造了新机会,欢迎感兴趣的研究人员咨询。